用地问题难解决
如汽车停车场紧张一样，农机的机棚、机库用地也是个大难题。《农民专业合作社法》和《农业机械化促进法》中尚未对农机合作社的场库棚建设用地做出明确规定。而用地问题又牵扯到国土、财税、规划等几个部门。因而很多合作社场库棚用地问题解决起来很难。
无机耕路成阻碍
下雨前的大抢收，湖北京山县永兴镇苏佘畈村小伙刘若峥驾着一台乘坐式收割机，在田坡上艰难调头，心急如焚。路太陡，又窄，每一次前进后退都要小心翼翼，一点疏忽恐怕就会翻到坡下，笔者在一旁看着心惊肉跳。两分钟后，刘若峥调过头，倒是轻车熟路地开在坑洼不平、只容一车驶过的乡间小道上，钻进另一片田。没有机耕路，成为大型农业机械发挥作用的阻碍。
从目前看，农田道路过窄，不利于大机械行走；林网太小，致使大机械难以使用；空运转时间太长，生产成本增加，农机合作社经营状况受到严重制约。
油价上涨成本高
湖北仙桃市郭河镇印湾村农机手印保鹏有台半喂入联合收割机，还打算买一台旋耕机，却纠结于柴油。“油价涨了好几次，前不久好不容易下调，可还是贵。”印保鹏说，油价若能再便宜20%~30%，农民购买农机就更有积极性了。仙桃张沟镇富民农机合作社陈华兵称，去年收冬小麦时闹“柴油荒”，发放的加油卡每天限量加100元的油，大型机械根本不够，况且有时根本加不到油。
目前实施的农业补贴政策中，燃油补贴是作为农业直补的一部分发放到土地承包者手中，而未能直接补到农机手和农机合作社。由于多数农户并不愿意提高作业价格，燃油价格上涨的成本最终还是要由农机手和农机合作社内部消化，相当于提高了经营成本。
合作社比较缺钱
湖北赤壁市军华农机合作社理事长祝江林与3个合伙人，磨破嘴皮，抵押了房产，才从中国邮政储蓄银行贷到20万元。“现在合作社购买大型机械，信用社、银行一般都很难贷到款，主要原因是农户缺乏银行认可的抵押物。”祝江林说，农机具银行不认，合作社对场库棚用地和流转经营的土地没有所有权，也无法作为抵押物进行融资。事实上，农机合作社多是自筹资金，场库棚建设和生产流动资金缺口较大。
