现代农业的首要任务是保障粮食，灌溉排水工程是最重要的基础设施。良好的灌排基础设施条件，是抵御自然灾害、大幅度降低农业成本、提高农业生产效率的必要条件。灌排自如，才能满足作物多样化要求、特别是高附加值作物种植要求，才能满足提高作物复种指数的要求，农业结构调整才有更大的回旋余地。贯彻落实《农业现代化规划（2016-2020年）》，要按照中央新时期“节水优先、空间均衡、系统治理、两手发力”的水利工作方针，大规模推进农田水利建设，加快农田水利基础设施现代化改造和管理体制机制改革，着力构建工程良好、用水、体制健全、机制灵活的农田水利支撑体系，补齐现代农业发展短板。
加快建设配套完善的灌溉排水工程体系。到2020年，要基本完成大型灌区、重点中型灌区续建配套和节水改造任务，实施大中型灌区现代化改造。结合新增千亿斤粮食生产能力规划实施，在水土资源条件具备的地区，新建一批灌区，增加农田有效灌溉面积3000万亩左右。完成大中型灌溉排水泵站更新改造，加强涝渍灾害严重地区治理，完善灌排体系。加强大中型灌区田间工程配套，促进旱涝保收高标准农田建设。加快推进中小型农田水利工程建设，结合脱贫攻坚，优先支持革命老区、民族地区、边疆地区、贫困地区小水窖、小水池、小塘坝、小泵站、小水渠等“五小水利”工程建设；结合农业种植结构调整，加强水源工程建设，改进灌溉排水条件。
大力发展节水灌溉。近20年来，在灌溉用水总量基本未增加的情况下，有效灌溉面积增加了2.3亿亩，灌溉保证率显著提高，主要依靠灌区节水改造和大规模发展节水灌溉。今后几年，适度增加有效灌溉面积以及提高灌溉保证率，从而提高农业综合生产能力和满足作物种植结构调整、提高复种指数的要求，都需要新增灌溉用水。在加快大中型灌区灌排工程设施节水改造步伐的同时，因地制宜采用适宜的节水灌溉技术和措施，在水资源短缺地区、生态脆弱地区和粮食主产区，集中连片、规模化推广节水灌溉技术。西北地区、山丘区要结合脱贫攻坚，因地制宜发展小微型节水灌溉系统。“十三五”期间，要新增节水灌溉工程面积1.4亿亩，其中节水灌溉面积1.0亿亩；农田灌溉水有效利用系数提高到0.55以上，农田灌溉用水总量控制在3720亿立方米以内。通过大力发展喷灌、微灌等节水灌溉技术，显著提高劳动生产率，促进“水肥药一体”管理，为推进农业适度规模经营、促进农业供给侧改革提供有力支撑。
深化农田水利管理体制改革。积极拓展农田水利投入渠道，建立农田水利多元投入机制。大力推进小型农田水利设施产权制度改革，切实落实管理主体和管护措施。深化农业水价综合改革，将工程改造、管理体制改革和水价改革结合起来，先建机制、后建工程，充分调动村组集体、农民用水合作组织的积极性。加强农民用水合作组织能力建设，鼓励农民用水合作组织与农民专业合作社联合或者融合。加强专业管理队伍建设，努力提高管理水平，尽快适应农业现代化发展对水利工程管理的要求。建立水利与农业良性互动的工作机制、用水的激励机制，培育种植能手、农民用水合作组织成为节水灌溉技术推广科技带头者。加强灌溉用水科学管理，严格灌溉水资源总量控制、定额管理，逐步完善灌溉用水计量体系，加强灌溉用水量和灌溉水质监测能力建设，促进水资源可持续利用，保障农业现代化发展。
