多年来，内蒙古自治区把耕地保护作为土地管理的首要任务，不断强化耕地保护主体责任。2012年，自治区制定下发了《内蒙古自治区盟行政公署市人民政府耕地保护责任目标考核办法》，将盟市长作为耕地保护的责任人，明确了具体考核要求。从自治区到盟市、旗县、乡镇，四级政府层层签订耕地保护目标责任状，逐级压实耕地保护责任。2014年开始，又将耕地保护工作列入自治区粮食责任制考核办法、党政领导干部生态环境损害责任追究实施细则中，促进了最严耕地保护制度的落实。
目前，内蒙古高标准基本农田建设成效显著。截至2015年底，建成高标准基本农田面积2268.36万亩，新增耕地面积近105万亩。经过土地整治，土地利用率提高8%，粮食单产水平提高近30%，项目区耕地生产成本普遍降低了50－320元/亩，农民人均新增农业年纯收入1200元左右，项目区受益人数达245万余人，贫困人口减少数量达24万人，农民对高标准农田建设总体满意度达92.75%。
耕地占补平衡质量明显提升。“十二五”以来，通过不断完善相关制度规定，我区对耕地占补平衡项目的评审、验收、报备和挂牌交易等工作进行了规范化管理。全区共投入建设资金7.3亿元，开发补充耕地52.8万亩，基本上是水利设施条件较好的耕地；全区建设占用耕地面积38.7万亩，均按照先补后占、占优补优的要求，实现了占补平衡。
基本农田划定和保护工作取得新进展。2013年以来，全区国土和农业部门组织各级对基本农田地块进行了核实确认，共核实确定基本农田8798万亩，并全部落实了地块和保护责任。在此基础上，建立了全区基本农田数据库，实现了基本农田落地到户，上图入库。按照的总体部署，认真组织开展了城市周边基本农田划定工作，在城市周边优质耕地中新划入基本农田面积315万亩，划定后全区城市（镇）周边基本农田面积达到817万亩，保护率由原来的46%提高到73%。这些基本农田将成为城市建设的实体边界和刚性约束，倒逼城市建设跳出去，搞串联式、组团式发展。我区划定工作受到国土资源部和农业部的肯定，在基本农田划定工作现场交流会上进行了经验交流。目前，全区基本农田划定成果全部完成省级验收。
非农建设占用耕地得到有效控制。近几年，我区坚持多措并举，开源节流，严格控制非农建设占用耕地，积极引导建设项目尽可能避让基本农田和高等别耕地，切实防止了耕地的流失。通过努力，盘活现有存量建设用地规模150万亩，复垦耕地6万亩，清理闲置土地7.3万亩，有效缓减了新增建设用地对占用耕地的压力。巴彦淖尔市和16个旗县（市）被评为国土资源节约集约模范县
